在《性教育实习》的第一堂课当天，男主角（男）通过抽签，意外地与班上最喜欢的女孩成为“实习”搭档。
刚结束理论课，终于迎来实践环节已经让他欣喜若狂，更何况还能和心仪的女孩发生关系，他几乎要飘起来了。但与此同时，不安也涌上心头。
因为是第一次做爱，他担心自己表现笨拙会被嫌弃。虽然喜欢对方，但一直只是远远观望，从未真正交谈过，不知道她对自己是什么看法。万一发现她意想不到的另一面，反而受到打击怎么办？越想越陷入无尽的焦虑中。
实习开始后，当他走向保健室，发现她已经先到了，然后——
『性教育実習』の最初の授業が始まったその日、主人公(男)はくじ引きの結果クラスで一番好きだった女の子と「実習」をすることになった。
座学を終えてようやく実習が始まっただけでも嬉しいのに、好きな子とエッチできることになり舞い上がらんとしていたが、同時に不安もあった。
初めてのエッチなので下手だと思われないだろうか。好きではあるものの遠目で見ていただけで話したこともないので、自分のことをどう思っているのだろうか。彼女の意外な一面を知ってし>まい逆にショックを受けてしまわないだろうか。想像したらキリがないほど不安な思いでいっぱいになってしまう。
実習が始まり保健室へ向かうと彼女は先に来ていて、そしてーー。